Вторник, 8 юли 2014 г. - Екип от изследователи от Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) участва в международно проучване, което установи 518 нови микробактерии, напълно неизвестни досега, в човешката микробиота (чревна флора).
Изследването, в което учените използват нов подход към биоинформатичния анализ, също разшири каталога на известните микробни гени от 3 на 10 милиона.
Резултатите от това изследване, публикувано в неделя от списанието Nature Biotechnology, са част от европейския проект MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), надарен с 11, 4 милиона евро, за да се проучи как човешкият микробиом се свързва със здравето и болестите, Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) е един от 13-те, участващи в този проект - и единственият испански център - под ръководството на д-р Франсиско Гуарнер, който обясни, че не всички изследвани проби имат това брой неизвестни видове.
Пробите от чревната флора на някои индивиди имат много малко от тези видове и при подробен анализ се вижда, че те са пробите на пациенти с болест на Крон. "Това предполага, че тези видове, досега неизвестни, вероятно са тези, които правят разлика между микробиотата на здрави хора и тази на болните", обяви Гуарнер.
Според изследователя тези данни отварят стратегии за опит за възстановяване на тези видове с хранителни интервенции: прилагане на фибри, пребиотици, които подпомагат селективния растеж на някои видове или пробиотици.
Тези неизвестни бактерии вероятно са от така наречените „добри бактерии“, защото не са типичните, които причиняват инфекция, нито са известни или изолирани преди. Според Гуарнър откритите бактерии не могат да бъдат изолирани, тъй като „почти сигурно те не биха оцелели извън дебелото черво, за да бъдат трансплантирани“.
Лицето, отговорно за работата и изследователят на VHIR групата по физиология и храносмилателна патофизиология, посочи, че откритите нови видове „не са обработваеми, са много чувствителни към кислород, тоест са много строги анаероби и установяват голяма зависимост от средата си, за да могат да оцелее “. "По същата причина, когато отидохме в базите данни, не намерихме следа и досега не знаехме нищо за тях", каза Гуарнер.
Откритието е станало възможно благодарение на нов подход към биоинформатичния анализ, който позволи на тези видове да "излязат на повърхността".
"Понастоящем - според Guarner - само 10% от секвенирания генетичен материал е известен с 95% надеждност. Това оставя огромна сива зона, върху която се работи в момента."
Проучването е открило 741 различни метагеномични вида, наречени заради невъзможността да им се присвои име. В контраст с базите данни, изследователите са установили, че 115 от тези видове са били вече известни, докато 518 са неизвестни; останалите 108 са частично известни.
"Сега знаем как изглежда геномът на тези метагеномични видове, но не и техните имена и фамилии", обясни Гуарнър.
Има малък брой, чиито видове не са известни, но техният пол или семейството, към което принадлежат, и приблизително 200 метагеномични вида от описаните не могат да бъдат класифицирани по никакъв начин, тъй като повече от 80% от техните гени са напълно неизвестни на днес.
Според учените микроорганизмите, които живеят при хората, са около 100 милиарда, 10 пъти повече от общия брой на човешките клетки.
Първоначалните резултати на същия този проект през 2010 г. сочат 3 300 000 различни гени, преведени в 20 000 различни функции, 5000 от които са напълно неизвестни досега.
Всеки човек има около 600 000 от тези микробни гени, а 300 000 се повтарят постоянно сред всички индивиди. "В това ново проучване броят се умножава по три и се достигат 9 879 896 различни гена", каза Гуарнер.
Източник:
Тагове:
Лекарства Психология Красота
Изследването, в което учените използват нов подход към биоинформатичния анализ, също разшири каталога на известните микробни гени от 3 на 10 милиона.
Резултатите от това изследване, публикувано в неделя от списанието Nature Biotechnology, са част от европейския проект MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), надарен с 11, 4 милиона евро, за да се проучи как човешкият микробиом се свързва със здравето и болестите, Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) е един от 13-те, участващи в този проект - и единственият испански център - под ръководството на д-р Франсиско Гуарнер, който обясни, че не всички изследвани проби имат това брой неизвестни видове.
Пробите от чревната флора на някои индивиди имат много малко от тези видове и при подробен анализ се вижда, че те са пробите на пациенти с болест на Крон. "Това предполага, че тези видове, досега неизвестни, вероятно са тези, които правят разлика между микробиотата на здрави хора и тази на болните", обяви Гуарнер.
"Добри бактерии"
Според изследователя тези данни отварят стратегии за опит за възстановяване на тези видове с хранителни интервенции: прилагане на фибри, пребиотици, които подпомагат селективния растеж на някои видове или пробиотици.
Тези неизвестни бактерии вероятно са от така наречените „добри бактерии“, защото не са типичните, които причиняват инфекция, нито са известни или изолирани преди. Според Гуарнър откритите бактерии не могат да бъдат изолирани, тъй като „почти сигурно те не биха оцелели извън дебелото черво, за да бъдат трансплантирани“.
Лицето, отговорно за работата и изследователят на VHIR групата по физиология и храносмилателна патофизиология, посочи, че откритите нови видове „не са обработваеми, са много чувствителни към кислород, тоест са много строги анаероби и установяват голяма зависимост от средата си, за да могат да оцелее “. "По същата причина, когато отидохме в базите данни, не намерихме следа и досега не знаехме нищо за тях", каза Гуарнер.
Различни метагеномични видове
Откритието е станало възможно благодарение на нов подход към биоинформатичния анализ, който позволи на тези видове да "излязат на повърхността".
"Понастоящем - според Guarner - само 10% от секвенирания генетичен материал е известен с 95% надеждност. Това оставя огромна сива зона, върху която се работи в момента."
Проучването е открило 741 различни метагеномични вида, наречени заради невъзможността да им се присвои име. В контраст с базите данни, изследователите са установили, че 115 от тези видове са били вече известни, докато 518 са неизвестни; останалите 108 са частично известни.
"Сега знаем как изглежда геномът на тези метагеномични видове, но не и техните имена и фамилии", обясни Гуарнър.
Има малък брой, чиито видове не са известни, но техният пол или семейството, към което принадлежат, и приблизително 200 метагеномични вида от описаните не могат да бъдат класифицирани по никакъв начин, тъй като повече от 80% от техните гени са напълно неизвестни на днес.
Човек има 600 000 микробни гена
Според учените микроорганизмите, които живеят при хората, са около 100 милиарда, 10 пъти повече от общия брой на човешките клетки.
Първоначалните резултати на същия този проект през 2010 г. сочат 3 300 000 различни гени, преведени в 20 000 различни функции, 5000 от които са напълно неизвестни досега.
Всеки човек има около 600 000 от тези микробни гени, а 300 000 се повтарят постоянно сред всички индивиди. "В това ново проучване броят се умножава по три и се достигат 9 879 896 различни гена", каза Гуарнер.
Източник:
