Понеделник, 24 юни 2013 г. - Учени от Австралия и Съединените щати предоставят нови знания за разбирането на триизмерната структура на генома, едно от най-големите предизвикателства, стоящи в момента в областта на геномиката и генетиката, чиито заключения публикува в своето цифрово издание. “ Природа генетика “.
Около три метра ДНК са плътно сгънати в ядрото на всяка клетка на нашето тяло, което позволява на някои гени да се "експресират" или активират, изключвайки други. Лекарите Тим Мърсър и Джон Матик от Института за медицински изследвания Гарван в Сидни и професор Джон Стаматоянопулос от Университета във Вашингтон в Сиатъл анализираха 3D структурата на генома с висока резолюция.
Гените са съставени от "екзони" и "интрони", като първите са последователностите, които кодират и експресират протеините, а последните - участъци от некодираща ДНК в средата. Тъй като гените се копират или транскрибират, от ДНК в РНК, интронните последователности се изрязват или "сплайсират", а останалите екзони се свързват заедно, за да образуват последователност, кодираща протеин. В зависимост от екзоните, които са изкривени, един и същ ген може да генерира различни протеини.
Чрез използването на големи количества данни от проекта ENCODE д-р Тим Мърсър и неговите колеги са извели сгъването на генома, установявайки, че дори и в рамките на един ген, избраните екзони са лесно изложени. „Представете си дълга и изключително сложна лоза, нейните усукани клони, които представят някакво грозде, което може лесно да се откъсне, като същевременно се крият други извън техния обсег“, той дава пример. Мърсър.
"В същото време си представете мързелив берач на плодове, който просто бере гроздето на една ръка разстояние - добавя той. - Същият принцип се прилага и за генома. Специфични гени и дори специфични екзони се поставят в обсега на сгъване." В този смисъл този изследовател посочва, че през последните години учените започнаха да оценяват как сгъването на генома помага да определят как се изразява и регулира.
"Това проучване дава първото показание, че триизмерната структура на генома може да повлияе на сплайсирането на гените. Можем да заключим, че геномът се сгъва по такъв начин, че промоторната област, последователността, която инициира транскрипцията на ген, е намерени до екзоните и всички те са отведени в машината за транскрипция “, подчертава той.
"Това подкрепя нов начин на гледане на нещата, че геномът се огъва около машината за транскрипция, а не обратното. Тези гени, които влизат в контакт с транскрипционната машина, получават копия, докато частите, които орбитат далеч те се игнорират “, заключава този изследовател.
Източник:
Тагове:
хранене Новини Регенерация
Около три метра ДНК са плътно сгънати в ядрото на всяка клетка на нашето тяло, което позволява на някои гени да се "експресират" или активират, изключвайки други. Лекарите Тим Мърсър и Джон Матик от Института за медицински изследвания Гарван в Сидни и професор Джон Стаматоянопулос от Университета във Вашингтон в Сиатъл анализираха 3D структурата на генома с висока резолюция.
Гените са съставени от "екзони" и "интрони", като първите са последователностите, които кодират и експресират протеините, а последните - участъци от некодираща ДНК в средата. Тъй като гените се копират или транскрибират, от ДНК в РНК, интронните последователности се изрязват или "сплайсират", а останалите екзони се свързват заедно, за да образуват последователност, кодираща протеин. В зависимост от екзоните, които са изкривени, един и същ ген може да генерира различни протеини.
Чрез използването на големи количества данни от проекта ENCODE д-р Тим Мърсър и неговите колеги са извели сгъването на генома, установявайки, че дори и в рамките на един ген, избраните екзони са лесно изложени. „Представете си дълга и изключително сложна лоза, нейните усукани клони, които представят някакво грозде, което може лесно да се откъсне, като същевременно се крият други извън техния обсег“, той дава пример. Мърсър.
"В същото време си представете мързелив берач на плодове, който просто бере гроздето на една ръка разстояние - добавя той. - Същият принцип се прилага и за генома. Специфични гени и дори специфични екзони се поставят в обсега на сгъване." В този смисъл този изследовател посочва, че през последните години учените започнаха да оценяват как сгъването на генома помага да определят как се изразява и регулира.
"Това проучване дава първото показание, че триизмерната структура на генома може да повлияе на сплайсирането на гените. Можем да заключим, че геномът се сгъва по такъв начин, че промоторната област, последователността, която инициира транскрипцията на ген, е намерени до екзоните и всички те са отведени в машината за транскрипция “, подчертава той.
"Това подкрепя нов начин на гледане на нещата, че геномът се огъва около машината за транскрипция, а не обратното. Тези гени, които влизат в контакт с транскрипционната машина, получават копия, докато частите, които орбитат далеч те се игнорират “, заключава този изследовател.
Източник:
